西南医科大学附属中医医院脾胃·风湿免疫病科是集医疗、教学、科研为一体的临床科室。建立于1987年，由第一任科主任周德端教授主持建设脾胃病科工作。自建科以来，科室以“病人为中心，突出中医特色，发扬中西医结合优势，提高临床疗效”为主题，坚持“精益求精、服务到“胃”的服务理念，不断发展、壮大。1997年批准为四川省中医药管理局中医重点专科（专病）建设科室，1999年通过验收并进入项目建设周期。2019年与上海长海医院李兆申院士团队合作，建成川滇黔渝结合部区域“国家消化道早癌防治中心联盟”及“国家消化病临床医学研究中心西南医科大学附属中医医院分中心”。科室现有医护专业技术人员40余名，其中教授3名，副教授7名，享受国务院政府特殊津贴专家1名，全国中医临床优秀人才2名，四川省名中医3人，四川省中医药管理局学术技术带头人2人。

同时，科室设立了内镜诊疗中心，其是医院重点打造的国内一流微创诊疗中心，占地面积2000余平方米，拥有国内外一流设施设备，采用中心化、一体化的管理模式，竭诚为患者提供专业化、精细化、无痛化、舒适化的医疗服务。该中心拥有电子胃镜、电子小肠镜、电子十二指肠镜、电子结肠镜、超声内镜、胶囊内镜、内镜追溯系统等国内外一流设施设备，专家团队人才济济，技术精湛，实力雄厚，广泛开展具有国内领先水平的内镜诊疗技术，包括早癌的诊断及内镜下粘膜剥离术（ESD）、超声内镜下细针穿刺术（EUS-FNA）、贲门失弛缓症经口内镜下肌切开术（POEM）、内镜经黏膜下隧道肿瘤切除术（STER）、内镜下食管胃底曲张静脉精准断流术（ESVD）、内镜下食管胃底曲张静脉硬化术（EIS）、内镜下食管胃底曲张静脉套扎术（EVL）、内镜下胃肠息肉粘膜切除术（EMR）、内镜下食管狭窄球囊扩张术(EBD)、内镜下钛夹止血及局部注射止血、胃肠道支架植入术、异物取出术、内镜下内痔硬化剂注射等，获得患者的广泛好评。